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近日，江西省林業(yè)科學(xué)院聯(lián)合省林業(yè)科技實驗中心研究采用PacBio HiFi長讀長測序結(jié)合Hi-C技術(shù)在國內(nèi)率先獲得首個染色體級別花櫚木全基因組。相關(guān)研究論文發(fā)表于《自然》子刊《科學(xué)數(shù)據(jù)》。
據(jù)介紹，花櫚木染色體水平基因組總大小為2.69Gb，BUSCO評估驗證基因組完整性達(dá)98.20%，其中共功能注釋到37366個基因，鑒定到2518個rRNA和1120個tRNA等非編碼RNA。
該基因組的發(fā)布填補了花櫚木遺傳學(xué)研究的空白，作為紅豆屬物種里少有的大基因組，其高重復(fù)序列比例與LTR主導(dǎo)的特征，為解析豆科基因組擴張機制提供了新視角，同時為花櫚木藥用成分生物合成途徑的解析及紅豆屬相關(guān)瀕危物種的保護與資源綜合開發(fā)利用提供了重要分子依據(jù)與理論基礎(chǔ)。
（江西省林科院珍貴樹種團隊供圖）
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